Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ46

Efcab2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab2Q9CQ46 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Efcab2Q9CQ46 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Efcab2Q9CQ46 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Efcab2Q9CQ46 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Efcab2Q9CQ46 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Efcab2Q9CQ46 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Efcab2Q9CQ46 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Efcab2Q9CQ46 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Efcab2Q9CQ46 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms