Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp3Q9CQ10 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp3Q9CQ10 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp3Q9CQ10 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
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