Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Bcl11bQ99PV8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Bcl11bQ99PV8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bcl11bQ99PV8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms