Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trim12aQ99PQ1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trim12aQ99PQ1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim12aQ99PQ1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim12aQ99PQ1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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