Protein–RNA interactions for Protein: Q99NG0

Rad54l2, Helicase ARIP4, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54l2Q99NG0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rad54l2Q99NG0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rad54l2Q99NG0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rad54l2Q99NG0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rad54l2Q99NG0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rad54l2Q99NG0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rad54l2Q99NG0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rad54l2Q99NG0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rad54l2Q99NG0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rad54l2Q99NG0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rad54l2Q99NG0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rad54l2Q99NG0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rad54l2Q99NG0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rad54l2Q99NG0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rad54l2Q99NG0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rad54l2Q99NG0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rad54l2Q99NG0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rad54l2Q99NG0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rad54l2Q99NG0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rad54l2Q99NG0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rad54l2Q99NG0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Rad54l2Q99NG0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rad54l2Q99NG0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rad54l2Q99NG0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rad54l2Q99NG0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rad54l2Q99NG0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rad54l2Q99NG0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rad54l2Q99NG0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Rad54l2Q99NG0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rad54l2Q99NG0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rad54l2Q99NG0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Rad54l2Q99NG0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Rad54l2Q99NG0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Rad54l2Q99NG0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Rad54l2Q99NG0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Rad54l2Q99NG0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rad54l2Q99NG0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rad54l2Q99NG0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rad54l2Q99NG0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rad54l2Q99NG0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rad54l2Q99NG0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rad54l2Q99NG0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rad54l2Q99NG0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rad54l2Q99NG0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rad54l2Q99NG0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rad54l2Q99NG0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rad54l2Q99NG0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rad54l2Q99NG0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Rad54l2Q99NG0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rad54l2Q99NG0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rad54l2Q99NG0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Rad54l2Q99NG0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rad54l2Q99NG0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rad54l2Q99NG0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rad54l2Q99NG0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rad54l2Q99NG0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rad54l2Q99NG0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rad54l2Q99NG0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms