Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rims1Q99NE5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rims1Q99NE5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rims1Q99NE5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms