Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a4dQ99N05 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a4dQ99N05 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a4dQ99N05 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a4dQ99N05 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a4dQ99N05 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a4dQ99N05 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a4dQ99N05 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a4dQ99N05 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a4dQ99N05 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a4dQ99N05 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms