Protein–RNA interactions for Protein: Q99MX1

Usp26, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp26Q99MX1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp26Q99MX1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp26Q99MX1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp26Q99MX1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp26Q99MX1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp26Q99MX1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp26Q99MX1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
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Usp26Q99MX1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp26Q99MX1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp26Q99MX1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp26Q99MX1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp26Q99MX1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp26Q99MX1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp26Q99MX1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp26Q99MX1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp26Q99MX1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp26Q99MX1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp26Q99MX1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp26Q99MX1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp26Q99MX1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp26Q99MX1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp26Q99MX1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp26Q99MX1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp26Q99MX1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Usp26Q99MX1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp26Q99MX1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp26Q99MX1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Usp26Q99MX1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp26Q99MX1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp26Q99MX1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp26Q99MX1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp26Q99MX1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp26Q99MX1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp26Q99MX1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp26Q99MX1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp26Q99MX1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Usp26Q99MX1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp26Q99MX1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Usp26Q99MX1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Usp26Q99MX1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp26Q99MX1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Usp26Q99MX1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Usp26Q99MX1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp26Q99MX1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp26Q99MX1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Usp26Q99MX1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp26Q99MX1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp26Q99MX1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp26Q99MX1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp26Q99MX1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp26Q99MX1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp26Q99MX1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp26Q99MX1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp26Q99MX1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp26Q99MX1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Usp26Q99MX1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp26Q99MX1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp26Q99MX1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp26Q99MX1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp26Q99MX1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp26Q99MX1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp26Q99MX1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp26Q99MX1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp26Q99MX1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp26Q99MX1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp26Q99MX1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp26Q99MX1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp26Q99MX1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp26Q99MX1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp26Q99MX1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp26Q99MX1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp26Q99MX1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp26Q99MX1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp26Q99MX1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms