Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BrapQ99MP8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BrapQ99MP8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms