Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PtprtQ99M80 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PtprtQ99M80 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
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PtprtQ99M80 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PtprtQ99M80 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
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