Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Nus1Q99LJ8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nus1Q99LJ8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nus1Q99LJ8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Nus1Q99LJ8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nus1Q99LJ8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nus1Q99LJ8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Nus1Q99LJ8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nus1Q99LJ8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nus1Q99LJ8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nus1Q99LJ8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Nus1Q99LJ8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nus1Q99LJ8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nus1Q99LJ8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nus1Q99LJ8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nus1Q99LJ8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nus1Q99LJ8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nus1Q99LJ8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nus1Q99LJ8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nus1Q99LJ8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nus1Q99LJ8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nus1Q99LJ8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nus1Q99LJ8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nus1Q99LJ8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nus1Q99LJ8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nus1Q99LJ8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nus1Q99LJ8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nus1Q99LJ8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nus1Q99LJ8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nus1Q99LJ8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nus1Q99LJ8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nus1Q99LJ8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nus1Q99LJ8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nus1Q99LJ8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nus1Q99LJ8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nus1Q99LJ8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms