Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clint1Q99KN9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms