Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn2aQ99KJ0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubxn2aQ99KJ0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms