Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hps4Q99KG7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms