Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE1

Me2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me2Q99KE1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Me2Q99KE1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Me2Q99KE1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Me2Q99KE1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Me2Q99KE1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Me2Q99KE1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Me2Q99KE1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Me2Q99KE1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Me2Q99KE1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Me2Q99KE1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Me2Q99KE1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms