Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC8

Vwa5a, von Willebrand factor A domain-containing protein 5A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5aQ99KC8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vwa5aQ99KC8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vwa5aQ99KC8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms