Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TrabdQ99JY4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TrabdQ99JY4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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