Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW5

Epcam, Epithelial cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpcamQ99JW5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EpcamQ99JW5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EpcamQ99JW5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EpcamQ99JW5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EpcamQ99JW5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EpcamQ99JW5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EpcamQ99JW5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EpcamQ99JW5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EpcamQ99JW5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EpcamQ99JW5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EpcamQ99JW5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EpcamQ99JW5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EpcamQ99JW5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EpcamQ99JW5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EpcamQ99JW5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EpcamQ99JW5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EpcamQ99JW5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EpcamQ99JW5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EpcamQ99JW5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EpcamQ99JW5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EpcamQ99JW5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EpcamQ99JW5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EpcamQ99JW5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EpcamQ99JW5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EpcamQ99JW5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EpcamQ99JW5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EpcamQ99JW5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EpcamQ99JW5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EpcamQ99JW5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.05■□□□□ 0
EpcamQ99JW5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EpcamQ99JW5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EpcamQ99JW5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.03■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EpcamQ99JW5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EpcamQ99JW5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EpcamQ99JW5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EpcamQ99JW5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EpcamQ99JW5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EpcamQ99JW5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EpcamQ99JW5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EpcamQ99JW5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EpcamQ99JW5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EpcamQ99JW5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EpcamQ99JW5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EpcamQ99JW5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EpcamQ99JW5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EpcamQ99JW5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EpcamQ99JW5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EpcamQ99JW5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms