Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pacsin3Q99JB8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms