Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctu1Q99J10 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctu1Q99J10 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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