Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PdgfdQ925I7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PdgfdQ925I7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms