Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tubb6Q922F4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tubb6Q922F4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms