Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Sf3b3Q921M3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sf3b3Q921M3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms