Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc49Q91YK0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms