Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Chrna2Q91X60 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chrna2Q91X60 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms