Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx11Q91WL6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx11Q91WL6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx11Q91WL6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx11Q91WL6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx11Q91WL6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx11Q91WL6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx11Q91WL6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx11Q91WL6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx11Q91WL6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx11Q91WL6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx11Q91WL6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx11Q91WL6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx11Q91WL6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx11Q91WL6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx11Q91WL6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx11Q91WL6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx11Q91WL6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx11Q91WL6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx11Q91WL6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx11Q91WL6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx11Q91WL6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx11Q91WL6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx11Q91WL6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx11Q91WL6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx11Q91WL6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx11Q91WL6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx11Q91WL6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx11Q91WL6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx11Q91WL6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx11Q91WL6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx11Q91WL6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx11Q91WL6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx11Q91WL6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx11Q91WL6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx11Q91WL6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms