Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tdrd3Q91W18 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tdrd3Q91W18 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tdrd3Q91W18 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tdrd3Q91W18 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tdrd3Q91W18 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tdrd3Q91W18 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tdrd3Q91W18 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tdrd3Q91W18 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tdrd3Q91W18 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tdrd3Q91W18 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tdrd3Q91W18 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tdrd3Q91W18 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tdrd3Q91W18 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tdrd3Q91W18 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tdrd3Q91W18 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tdrd3Q91W18 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tdrd3Q91W18 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tdrd3Q91W18 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tdrd3Q91W18 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tdrd3Q91W18 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tdrd3Q91W18 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tdrd3Q91W18 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tdrd3Q91W18 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tdrd3Q91W18 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tdrd3Q91W18 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tdrd3Q91W18 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tdrd3Q91W18 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tdrd3Q91W18 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tdrd3Q91W18 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tdrd3Q91W18 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tdrd3Q91W18 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tdrd3Q91W18 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tdrd3Q91W18 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tdrd3Q91W18 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms