Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT1

Nsmce2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce2Q91VT1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nsmce2Q91VT1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nsmce2Q91VT1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms