Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIK3

H1foo, Histone H1oo, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1fooQ8VIK3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H1fooQ8VIK3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms