Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cul7Q8VE73 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cul7Q8VE73 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cul7Q8VE73 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cul7Q8VE73 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cul7Q8VE73 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cul7Q8VE73 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cul7Q8VE73 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cul7Q8VE73 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cul7Q8VE73 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cul7Q8VE73 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cul7Q8VE73 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cul7Q8VE73 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cul7Q8VE73 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cul7Q8VE73 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cul7Q8VE73 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cul7Q8VE73 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cul7Q8VE73 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cul7Q8VE73 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cul7Q8VE73 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cul7Q8VE73 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cul7Q8VE73 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cul7Q8VE73 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cul7Q8VE73 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Cul7Q8VE73 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cul7Q8VE73 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cul7Q8VE73 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms