Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG3

Parn, Poly(A)-specific ribonuclease PARN, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParnQ8VDG3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ParnQ8VDG3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ParnQ8VDG3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms