Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD37

Sgip1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgip1Q8VD37 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgip1Q8VD37 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sgip1Q8VD37 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgip1Q8VD37 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms