Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Fam20bQ8VCS3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Fam20bQ8VCS3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Fam20bQ8VCS3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Fam20bQ8VCS3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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Fam20bQ8VCS3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam20bQ8VCS3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
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Fam20bQ8VCS3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam20bQ8VCS3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam20bQ8VCS3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam20bQ8VCS3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam20bQ8VCS3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam20bQ8VCS3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam20bQ8VCS3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam20bQ8VCS3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam20bQ8VCS3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam20bQ8VCS3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam20bQ8VCS3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam20bQ8VCS3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam20bQ8VCS3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam20bQ8VCS3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam20bQ8VCS3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam20bQ8VCS3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam20bQ8VCS3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam20bQ8VCS3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam20bQ8VCS3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam20bQ8VCS3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam20bQ8VCS3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam20bQ8VCS3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam20bQ8VCS3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam20bQ8VCS3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam20bQ8VCS3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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