Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

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Length 918 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rapgef3Q8VCC8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rapgef3Q8VCC8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rapgef3Q8VCC8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Rapgef3Q8VCC8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rapgef3Q8VCC8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rapgef3Q8VCC8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rapgef3Q8VCC8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Rapgef3Q8VCC8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rapgef3Q8VCC8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rapgef3Q8VCC8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms