Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc58Q8R3Q6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc58Q8R3Q6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc58Q8R3Q6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms