Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk8Q8R3L8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms