Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim29Q8R2Q0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms