Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0F3

Sumf1, Sulfatase-modifying factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumf1Q8R0F3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sumf1Q8R0F3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sumf1Q8R0F3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sumf1Q8R0F3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sumf1Q8R0F3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sumf1Q8R0F3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sumf1Q8R0F3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sumf1Q8R0F3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sumf1Q8R0F3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sumf1Q8R0F3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sumf1Q8R0F3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sumf1Q8R0F3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sumf1Q8R0F3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sumf1Q8R0F3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sumf1Q8R0F3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sumf1Q8R0F3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sumf1Q8R0F3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sumf1Q8R0F3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sumf1Q8R0F3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sumf1Q8R0F3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sumf1Q8R0F3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sumf1Q8R0F3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sumf1Q8R0F3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sumf1Q8R0F3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sumf1Q8R0F3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sumf1Q8R0F3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sumf1Q8R0F3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sumf1Q8R0F3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sumf1Q8R0F3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sumf1Q8R0F3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sumf1Q8R0F3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sumf1Q8R0F3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sumf1Q8R0F3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sumf1Q8R0F3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sumf1Q8R0F3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sumf1Q8R0F3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms