Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casc3Q8K3W3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Casc3Q8K3W3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Casc3Q8K3W3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casc3Q8K3W3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casc3Q8K3W3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casc3Q8K3W3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casc3Q8K3W3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casc3Q8K3W3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casc3Q8K3W3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casc3Q8K3W3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casc3Q8K3W3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casc3Q8K3W3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casc3Q8K3W3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casc3Q8K3W3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casc3Q8K3W3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casc3Q8K3W3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Casc3Q8K3W3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casc3Q8K3W3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casc3Q8K3W3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casc3Q8K3W3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casc3Q8K3W3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casc3Q8K3W3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casc3Q8K3W3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Casc3Q8K3W3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Casc3Q8K3W3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casc3Q8K3W3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Casc3Q8K3W3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casc3Q8K3W3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casc3Q8K3W3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casc3Q8K3W3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Casc3Q8K3W3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casc3Q8K3W3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casc3Q8K3W3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms