Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Q3

Foxn4, Forkhead box protein N4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn4Q8K3Q3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxn4Q8K3Q3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxn4Q8K3Q3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms