Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms