Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Vrk3Q8K3G5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Vrk3Q8K3G5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Vrk3Q8K3G5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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