Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms