Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ncapd2Q8K2Z4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms