Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms