Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brd3Q8K2F0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Brd3Q8K2F0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms