Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mtmr3Q8K296 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mtmr3Q8K296 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mtmr3Q8K296 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mtmr3Q8K296 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Mtmr3Q8K296 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mtmr3Q8K296 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Mtmr3Q8K296 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Mtmr3Q8K296 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mtmr3Q8K296 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mtmr3Q8K296 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mtmr3Q8K296 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mtmr3Q8K296 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mtmr3Q8K296 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mtmr3Q8K296 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mtmr3Q8K296 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mtmr3Q8K296 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mtmr3Q8K296 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mtmr3Q8K296 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Mtmr3Q8K296 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mtmr3Q8K296 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mtmr3Q8K296 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mtmr3Q8K296 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mtmr3Q8K296 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mtmr3Q8K296 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mtmr3Q8K296 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mtmr3Q8K296 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mtmr3Q8K296 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mtmr3Q8K296 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms