Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Neil3Q8K203 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Neil3Q8K203 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Neil3Q8K203 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Neil3Q8K203 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Neil3Q8K203 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Neil3Q8K203 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Neil3Q8K203 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Neil3Q8K203 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Neil3Q8K203 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Neil3Q8K203 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Neil3Q8K203 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Neil3Q8K203 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Neil3Q8K203 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Neil3Q8K203 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Neil3Q8K203 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Neil3Q8K203 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Neil3Q8K203 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Neil3Q8K203 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil3Q8K203 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil3Q8K203 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil3Q8K203 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil3Q8K203 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil3Q8K203 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil3Q8K203 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil3Q8K203 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil3Q8K203 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil3Q8K203 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil3Q8K203 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil3Q8K203 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil3Q8K203 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil3Q8K203 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil3Q8K203 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil3Q8K203 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil3Q8K203 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil3Q8K203 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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