Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prkd3Q8K1Y2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prkd3Q8K1Y2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prkd3Q8K1Y2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prkd3Q8K1Y2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prkd3Q8K1Y2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prkd3Q8K1Y2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prkd3Q8K1Y2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prkd3Q8K1Y2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prkd3Q8K1Y2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prkd3Q8K1Y2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prkd3Q8K1Y2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkd3Q8K1Y2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkd3Q8K1Y2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkd3Q8K1Y2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkd3Q8K1Y2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkd3Q8K1Y2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkd3Q8K1Y2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkd3Q8K1Y2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkd3Q8K1Y2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkd3Q8K1Y2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkd3Q8K1Y2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkd3Q8K1Y2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkd3Q8K1Y2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkd3Q8K1Y2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkd3Q8K1Y2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkd3Q8K1Y2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkd3Q8K1Y2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkd3Q8K1Y2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkd3Q8K1Y2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkd3Q8K1Y2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkd3Q8K1Y2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms