Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S6

Spire2, Protein spire homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire2Q8K1S6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spire2Q8K1S6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Spire2Q8K1S6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms